約 5,517,005 件
https://w.atwiki.jp/metalmetabo/pages/34.html
- visitors In vivo analysis of intracellular amino acid labelings by GC/MS. C Wittmann, M Hans, E Heinzle - Analytical biochemistry, 2002 - mendeley.com ... TBDMS derivatization of amino acids is especially useful in metabolic network analysis, because M-57 fragments containing the entire carbon skeleton of the analyte can be observed by GC/MS with high signal intensities 8. The potential of the method is exemplified for ... Comparative metabolic flux analysis of lysine-producing Corynebacterium glutamicum cultured on glucose or fructose nih.gov [HTML]P Kiefer, E Heinzle, O Zelder, C … - Applied and …, 2004 - Am Soc Microbiol ... A comprehensive approach to 13 C tracer studies, labeling measurements by gas chromatography-mass spectrometry, metabolite balancing, and isotopomer modeling, was applied for comparative metabolic network analysis of lysine-producing Corynebacterium glutamicum ... It is all about metabolic fluxes nih.gov [HTML]J Nielsen - Journal of bacteriology, 2003 - Am Soc Microbiol http //scholar.google.com/scholar?q=related xAvLLrdbbNYJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... I. Experimental observations. Biotechnol. Bioeng. 55 305-316.[CrossRef] 21; Thykaer, J., B. Christensen, and J. Nielsen. 2002. Metabolic network analysis of an adipoyl-7-ADCA producing strain of Penicillium chrysogenum elucidation of adipate degradation.Metab. Eng. ... Using topology of the metabolic network to predict viability of mutant strains biomedcentral.com [PDF]Z Wunderlich, L Mirny - Genome Biology, 2005 - biomedcentral.com http //scholar.google.com/scholar?q=related sTavonuje7wJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... Ph.D. Thesis. University of Leeds; 1994. 14. Papp B, Pal C, Hurst LD Metabolic network analysis of the causes and evolution of enzyme dispensability in yeast. Nature 2004, 429(6992) 661-664. 15. Jeong H, Tombor B, Albert R, Oltvai ZN, Barabasi AL The large-scale ... Novel proteins, putative membrane transporters, and an integrated metabolic network are revealed by quantitative proteomic analysis of Arabidopsis cell … plantphysiol.org [HTML]H Eubel, EH Meyer, NL Taylor, JD Bussell, N O … - Plant …, 2008 - Am Soc Plant Biol http //scholar.google.com/scholar?q=related aCgbR-dAtyMJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... This is aided by a metabolic network analysis that reveals a tight integration of functions and highlights specific metabolite nodes that most probably represent entry and exit metabolites that could require transport across the peroxisomal membrane. ... High-throughput phenomics experimental methods for mapping fluxomes bjmu.cn [PDF]U Sauer - Current opinion in Biotechnology, 2004 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related XvhSxXXwbn4J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... From its early days when material fluxes were balanced within assumed reaction networks [7.], metabolic network analysis [6. and 8.] has matured to actually identify the topology of active reactions and pathways and to quantify the molecular flux through them on a variety of ... Use of genome-scale microbial models for metabolic engineering KR Patil, M Åkesson, J Nielsen - Current opinion in biotechnology, 2004 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related oAOz5SBTVHAJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... incorporate genome-scale biological data. Genome-scale stoichiometric models of microorganisms represent a first step in this direction. FBA, flux balance analysis; MFA, metabolic flux analysis; MNA, metabolic network analysis. ... Network identification and flux quantification in the central metabolism of Saccharomyces cerevisiae under different conditions of glucose repression nih.gov [HTML]AK Gombert, M Moreira dos Santos, B … - Journal of …, 2001 - Am Soc Microbiol http //scholar.google.com/scholar?q=related R5V_AodxCrwJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... flux estimates. The use of 13 C-labeled substrates enables both identification of the metabolic network structure and quantification of the metabolic fluxes and is therefore referred to as metabolic network analysis (5). This kind ... Metabolic flux analysis of Escherichia coli K12 grown on 13C-labeled acetate and glucose using GC-MS and powerful flux calculation method freelogy.org [PDF]J Zhao, K Shimizu - Journal of biotechnology, 2003 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related w1m-5IKYKpsJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Structural and functional analysis of cellular networks with CellNetAnalyzer biomedcentral.com [HTML]S Klamt, J Saez-Rodriguez, ED Gilles - BMC Systems Biology, 2007 - biomedcentral.com http //scholar.google.com/scholar?q=related bzwlVku0FL8J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... CNA extends its predecessor FluxAnalyzer, originally developed for metabolic network analysis[7], by new methods for signalling and regulatory networks, ie for networks where signal flows are dominating (in contrast to mass flows in metabolic networks). ...
https://w.atwiki.jp/2chgoukemijikobousi/pages/21.html
＝物質情報＝ 【物質名】 Methylone：2-methylamino-1-(3,4-methylenedioxyphenyl)propan-1-one 【摂取量目安】 経口摂取 125-200mg （ErowidにDose記載無しの為、レポートより） 【持続時間目安】 経口 2 - 4時間 耐性や摂取量で大幅に前後する可能性があります。 【死亡事例の有無（分かる範囲で）】 【禁忌】 【参考リンク】 Erowid： ttp //www.erowid.org/chemicals/methylone/methylone.shtml ※摂取量や持続時間はあくまで目安です。体重・精神及び肉体的な向き不向きがあります。 酒類・他の薬との併用は重大な事故を起こす可能性があります。
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リンク HTMLクイックリファレンス http //www.htmq.com/index.htm HTML5ゲームフレームワーク http //blog.verygoodtown.com/2011/02/limejs-html5-game-framework/ HTML5でゲーム作成 http //cnut1024.wiki.fc2.com/ SEO対策 http //seo.acnf.org/ http //www.d3.dion.ne.jp/~jkondou/hp/css_seo.html G123、事前受付登録中の「クイーンズブレイドリミットブレイク」にてAmazonギフト券が当たるフォロー&RTキャンペーン開催 - ASCII.jp HTML5 プロフェッショナル 認定試験 レベル1 想定問題 一覧 (1) - マイナビニュース [実力試し] HTML5 プロフェッショナル 認定試験 レベル2 想定問題 一覧 (1) - マイナビニュース HTML5ベースのMMORPG「MAD WORLD」のαテストが実施中。PCブラウザですぐに参加可能 - 4Gamer.net W3C／HTML5からWHATWG／Living Standardへ、Web発展史をひもとく - ITpro 「Macでリモートアクセス」に対応、Windows 365やシン・テレワークシステムHTML5版の魅力 | ボクシルマガジン - Beyond（ビヨンド） 「シン・テレワークシステム」にHTML5版 ～MacやChromebookからもWindowsをリモート操作可能に - 窓の杜 拡張機能が動かなくなるかも？ 「Google ドキュメント」がHTML5 Canvasベースのレンダリングへ移行 - 窓の杜 新作HTML5ゲーム「邪神ちゃんドロップキックねばねばウォーズ」が配信開始。レアリティS“水着ぴの”がもらえる初心者ミッションを開催中 - 4Gamer.net AWS Elemental MediaLive が HTML5 モーショングラフィックスオーバーレイのサポートを開始 - amazon.com HTML5ベースのモダンブラウザーからリモート操作が可能に、「TeamViewer」にWebクライアント - 窓の杜 GMOメディア：HTML5ゲームプラットフォーム「ゲソてん byGMO」、「楽天ポイントモール」の利用者に向け38タイトルを提供開始 - PR TIMES 第4回専門学校 HTML5作品アワード、受賞作品の発表 - valuepress HTML5に完全対応 アドビ社製Webセミナーシステムの最新バージョン『AdobeConnect11』を提供開始 - アットプレス（プレスリリース） GMOメディア：HTML5ゲームプラットフォーム「ゲソてん」、ゲームコンテンツ提供先の20媒体において「PayPay」決済に対応 - PR TIMES HTML5ベースの韓国産2D MMORPG「MAD WORLD」の最新画像とムービーが公開 - 4Gamer.net Flashを使用している企業に朗報！Flashを簡単にHTML5で再生可能にするサービス『JswfPlayer』Ver2がリリース！ - PR TIMES SL ジャパン、HTML5 に対応した監視制御システム (DCS/SCADA) 向け SL-GMS Web/Developer 新製品をリリース - valuepress HTML5ゲーム「八男って、それはないでしょう！アンサンブルライフ」の正式サービスが本日開始。テレビアニメ版がベースの放置型MMORPG - 4Gamer.net TVアニメの新作HTML5ゲーム『八男って、それはないでしょう！-アンサンブルライフ』本日より正式リリース！記念イベント絶賛開催中！ - PR TIMES アスキーゲーム ガンダムRPG『SDガンダムオペレーションズ』がHTML5軽量化アップデートを実施！ - ASCII.jp 神社経営シミュレーション「かみてる」がHTML5ゲームプラットフォームOhSECHIで配信開始 - 4Gamer.net 人気TVアニメの新作HTML5ゲーム『八男って、それはないでしょう！-アンサンブルライフ-』事前登録受付開始！ - PR TIMES 文系でもできる！HTML５とCSS3の超らくらく入門講座 2020年版 - PR TIMES YouTubeがFlashを排除し、HTML5の最後の障害を取り除いた - 週刊アスキー - 週アスPLUS バンナム、HTML5ゲームの「enza」運営元を完全子会社化 ドリコム保有株買い取り - ITmedia G123で新作HTML5ゲーム『セルリアンホライズン』正式リリース！事前登録報酬は28日にプレゼント！ - PR TIMES GMOメディア：HTML5ゲームプラットフォーム「ゲソてん」、ポイントサイト「モッピー」に『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪横丁』など20タイトルを提供開始 - PR TIMES シンプルで安価なマルチデバイス対応HTML5デジタルカタログ制作サービスを提供開始 - PR TIMES スマホゲーム開発者向け書籍「HTML5 ゲーム開発の教科書」が9月中旬に発売 - 4Gamer Adobe FlashをHTML 5で代替するPixi.jsがWebGLを新たにサポート、クロスプラットフォームとインタラクティブアプリに対応 - InfoQ Japan HTML5版「刀剣乱舞」をサポートした「とうらぶキャプ」v2.0.0が公開 - 窓の杜 HTML5ゲームポータル「楽天ゲームズ」終了 2年で幕 - ITmedia NEWS HTML5ゲーム『ガールズ＆クリーチャーズ』ホワイトデーイベント開催！期間限定キャラクターを解禁！ - PR TIMES HTML5ゲームプラットフォームをてがけるLiberappは「HTML5 スマホゲーム業界カオスマップ（2019β）」を公開しました - PR TIMES Liberappが「HTML5 スマホゲーム業界カオスマップ（2019β）」を公開 - 4Gamer.net スマートニュース、優れたHTML5技術を持つ『Tombo, Inc.』を買収 - PR TIMES HTML5 GameCreatorというコミュニティー＆ミートアップをはじめます - PR TIMES あなたはどっちサイドを選ぶ？G123新作HTML5ゲーム『ガールズ＆クリーチャーズ』正式リリース！ - PR TIMES 「Webは次のギアにシフトしている」〜HTML5 Conference 2018 基調講演レポート：レポート - Gihyo Jp HTML5ベースで描画速度が向上、BIダッシュボードの最新版 - ＠IT MONOist 時空を超えて、世界を救え！新作HTML5ゲーム『ナイトメアクロノス』事前登録受付開始！ - PR TIMES 国内最大級のHTML5ゲームサービス「G123.jp」が本日10月4日(木)オープン！ - PR TIMES 国内最大級のHTML5ゲームサービス「G123.jp」オープン！新たなゲームプラットフォーム誕生・10月は新作ゲーム3本登場 - アットプレス 技術の進化に左右されないWebサイトの作り方がわかる、プロを目指す人のための入門書『HTML5＋CSS3の新しい教科書 改訂新版 基礎から覚える、深く理解できる。』発売 - PR TIMES 「艦これ」Flash→HTML5に 大規模メンテスタート - ITmedia 「艦隊これくしょん -艦これ-」がHTML5ベースに移行。8月15日11：55から3日がかりの大規模なメンテナンスを実施 - 4Gamer.net LINE上でHTML5ゲームが遊べる「LINE QUICK GAME」 たまごっち、ナンプレも - ITmedia HTML5ゲームにもeスポーツの熱狂を。 Liberappに観戦APIとデモゲームを追加 - PR TIMES BXD、HTML5プラットフォーム名称を「enza」に--新作ゲーム3タイトルを体験 - CNET Japan バンナム、HTML5活用の新作ゲーム「アイドルマスター シャイニーカラーズ」発表 - CNET Japan HTML5アプリプラットフォームのスタートアップ企業「Liberapp」設立と増資および仮想通貨「リベリウム」でICO検討開始のお知らせ - PR TIMES 株式会社レコム、HTML5ゲーム【iKON COLLECTION HIDDEN CATCH】のセールイベントを開催! 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https://w.atwiki.jp/metalmetabo/pages/28.html
- visitors Application of regulatory sequence analysis and metabolic network analysis to the interpretation of gene expression data psu.edu [PDF]J Van Helden, D Gilbert, L Wernisch, M Schroeder, … - Computational …, 2001 - Springer http //scholar.google.com/scholar?q=related JS_4j3CP5nEJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Comparative metabolic network analysis of two xylose fermenting recombinant Saccharomyces cerevisiae strains T Grotkjær, P Christakopoulos, J Nielsen, L … - Metabolic Engineering, 2005 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related m6nOh8HQbaIJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 The recombinant xylose fermenting strain Saccharomyces cerevisiae TMB3001 can grow on xylose, but the xylose utilisation rate is low. One important reason for the inefficient fermentation of xylose to ethanol is believed to be the imbalance of redox co-factors. In the present ... The Edinburgh human metabolic network reconstruction and its functional analysis nih.gov [HTML]H Ma, A Sorokin, A Mazein, A Selkov, E … - Molecular systems …, 2007 - nature.com http //scholar.google.com/scholar?q=related pgWLepUKeS0J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... A main objective of human metabolic network analysis is to see how it is related with human disease. More than 10 000 human genes (half of the whole genome) have been reported to be related with one or more human diseases in the OMIM database (Hamosh et al, 2005). ... Reconstruction of metabolic networks from genome data and analysis of their global structure for various organisms oxfordjournals.org [PDF]H Ma, AP Zeng - Bioinformatics, 2003 - Oxford Univ Press http //scholar.google.com/scholar?q=related SuHZgSLeNw8J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... It is one of the main tasks of metabolic network analysis to find possible conversion pathways between two metabolites. There may be many different pathways between two metabolites, among them the shortest pathway is of particular interest for network analysis. ... Metabolic network analysis of an adipoyl-7-ADCA-producing strain of Penicillium chrysogenum elucidation of adipate degradation J Thykaer, B Christensen, J Nielsen - Metabolic Engineering, 2002 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related gycTvJYwT9kJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 An adipoyl-7-ADCA-producing, recombinant strain of Penicillium chrysogenum was characterized by metabolic network analysis, with special focus on the degradation of adipate and determination of the metabolic fluxes. Degradation of the side-chain precursor, adipate, causes an ... Potential metabolic limitations in lysine production by Corynebacterium glutamicum as revealed by metabolic network analysis JA Hollander - Applied Microbiology and Biotechnology, 1994 - Springer http //scholar.google.com/scholar?q=related BwIeARCnafMJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Corynebacterium glutamicum and closely related Brevi- bacterium species are the most important organisms used for the industrial fermentative production of ly- sine. Although wild-type strains do not excrete lysine at all, classical mutation programs have resulted in strains ... Metabolic flux and metabolic network analysis of Penicillium chrysogenum using 2D [13C, 1H] COSY NMR measurements and cumulative bondomer simulation WA van Winden, WM van Gulik, D … - Biotechnology and …, 2003 - Wiley Online Library http //scholar.google.com/scholar?q=related Jy6SBrqyeHAJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Abstract At present two alternative methods are avail- able for analyzing the fluxes in a metabolic network (1) combining measurements of net conversion rates with a set of metabolite balances including the cofactor bal- ances, or (2) leaving out the cofactor balances and fitting the ... Metabolic‐flux and network analysis in fourteen hemiascomycetous yeasts LM Blank, F Lehmbeck, U Sauer - FEMS yeast research, 2005 - Wiley Online Library http //scholar.google.com/scholar?q=related ILl2ugZn3ZcJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... (5). Oxaloacetate14 mit was estimated using Eq. (6)[16] (6). 2.6Metabolic-network analysis. We used a previously constructed metabolic network [1,24], which consists of the PP pathway, glycolysis, TCA cycle, gluconeogenesis, malic enzyme and by-product formation reactions. ... 13C metabolic flux analysis W Wiechert - Metabolic Engineering, 2001 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related Eat1pl-yJGQJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... 6. B. Christensen and J. Nielsen, Metabolic network analysis, a powerful tool in metabolic engineering. Adv. Biochem. Eng. ... 209–231. 7. B. Christensen and J. Nielsen, Metabolic network analysis of Penicillium chrysogenum using 13 C-labeled glucose. Biotechnol. Bioeng. ... Multiple knockout analysis of genetic robustness in the yeast metabolic network tau.ac.il [PDF]D Deutscher, I Meilijson, M Kupiec, E Ruppin - Nature genetics, 2006 - nature.com http //scholar.google.com/scholar?q=related X5cH6RUwUF0J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... | PubMed |; Kitano, H. Biological robustness. Nat. Rev. Genet. 5, 826–837 (2004). | Article | PubMed | ISI | ChemPort |; Papp, B. , Pál, C. Hurst, LD Metabolic network analysis of the causes and evolution of enzyme dispensability in yeast. Nature 429, 661–664 (2004). ...
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Windows で、HTTPでのやり取りを眺めるツール。 HTTP debug tool IE ---- Fiddler2 http //www.fiddler2.com/Fiddler2/firstrun.asp extension http //www.fiddler2.com/fiddler2/extensions.asp Firefox ---- Firebug 文字コード明示 html lang="ja" まず、 html の中で使用言語を示します。ja は日本語を示します。 日本語以外では en (英語)、fr (フランス語)、de (ドイツ語)、zh (中国語) などがあります。 meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Shift_JIS" METAタグのContent-typeを明示すると同時に文字コードも明示します。 Shift_JIS 以外は EUC-JP, iso-2022-jp (JIS), UTF-8(Unicode) などがあります。 Shift_JIS はアンダーバー。EUC-JP と iso-2022-jp, UTF-8はハイフンです。 × content="text/html;" charset="Shift_JIS" ○ content="text/html; charset=Shift_JIS" 行間を広げる BODY STYLE="line-height 150%" line-heightの活用 div style="font 900 46pt;line-height 6pt;" div style="color #404040;text-indent 50px;" abc /div div style="color #808080;text-indent 100px;" def /div div style="color red;text-indent 150px;" ghi /div /div スタイルシートを使ったテキストフィルタ http //www.tohoho-web.com/css/filter.htm スタイルシートクイックレファレンス http //www.htmq.com/style/index.shtml 以下広告
https://w.atwiki.jp/htmlsakusei/pages/4.html
htmlの特徴 htmlを使うとこういうことができます。 種類 できること ドロップダウンリスト 決められた項目から選択できる リストボックス 同じ ほかにもいろいろあります。
https://w.atwiki.jp/yama213/pages/28.html
グラフ描画について WinChart Infragistics（グレープシティ） 有料 ￥102,900 TrueWinChart：http //www.grapecity.com/japan/support/database/p7_387.htm ランタイムフリー…配布可能ファイルなら、配布してよし Chart FX for .NET ComponentSource 有料 ￥382,620 Chart FX for .NET：http //www.componentsource.co.jp/products/chart-fx-net/index.html MSChartコントロール Microsoft提供のグラフ作成ライブラリ デザイナーを使用するには、VisualStudio2008が必要だが、2005でも使用は可能。 .NETFramework4.0以降は標準装備されるらしい。 しかし、MSChartを実行環境にインストールする必要がある。 参考：http //www.kanazawa-net.ne.jp/~pmansato/net/net_mschart.htm サンプル：http //code.msdn.microsoft.com/mschart NPlot 3-clause-BSD 簡単な（質素な？）グラフ作成はできる。 どこまでカスタマイズ可能か… NPlot：http //netcontrols.org/nplot/wiki/index.php 参考：http //database-tearoom.seesaa.net/article/12916797.html http //database-tearoom.seesaa.net/article/13656686.html 円グラフ未実装 ZedGraph LGPLライセンス 逆コンパイルを認める必要あり？ ライブラリ事態は使いやすいかも 拡大や移動もでき、高機能 ZedGraph：http //zedgraph.org/wiki/index.php?title=Main_Page 参考：http //www.atmarkit.co.jp/fdotnet/vblab/extcompo_02/zedgraph_01.html A flexible charting library for .NET LGPLライセンス QuickGraph Microsoft Public License (Ms-PL) QuickGraph：http //www.codeplex.com/quickgraph グラフというより、ダイアグラム系か？ Piccolo2D 3-clause-BSD グラフというより、ダイアグラム系
https://w.atwiki.jp/0x0b/pages/75.html
仕様 SGML(Standard Generalized Markup Language) ISO 8879 1986 JIS X 4151 1992 DSSSL(Document Style Semantics and Specification Language) DTD(Document Type Definition) DSDL(Document Schema Definition Languages) TEX HTML HTML 4.01 Specification HTML 5 XML XML1.0 XML1.1 SAX(Simple API for XML) XML-RPC XML Schema XSL(Extensible Stylesheet Language) XSLT(XSL Transformations) XPath(XML Path Language) XSL-FO(XSL Formatting Objects) XPL(XML Paper Specification) XUL(XML User Interface Language) XML Information Set, XML Infoset XML Schema TREX(Tree Regular Expressions for XML) RELAX(Regular Language description for XML) RELAX NG Namespaces in XML XML Signature XAdES(XML Advanced Electronic Signatures) XML Encryption SOAP Canonical XML XML Inclusions XQuery XPointer(XML Pointer Language) StAX(Streaming API for XML - Java SimpleXML - PHP System.Xml.XmlReader - .NET Framework JAXB(Java Architecture for XML Binding) XLink XML Media Types RFC 3023 Atom RFC4287 RFC5023 (Representational State Transfer) DocBook、RSS、MathML(Mathematical Markup Language)、ebXML、Scalable Vector Graphics (SVG)、 MusicXML VML(VoiceXML) XML Base ISO/IEC 8825-4 2002 Information technology -- ASN.1 encoding rules XML Encoding Rules (XER) ISO/IEC 8825-5 2004 Information technology -- ASN.1 encoding rules Mapping W3C XML schema definitions into ASN.1 ISO/IEC 9075-14 2006 Information technology -- Database languages -- SQL -- Part 14 XML-Related Specifications (SQL/XML) ISO 10303-28 2007 Industrial automation systems and integration -- Product data representation and exchange -- Part 28 Implementation methods XML representations of EXPRESS schemas and data, using XML schemas ISO/IEC 13250-3 2007 Information technology -- Topic Maps -- Part 3 XML syntax ISO/IEC 13522-5 1997 Information technology -- Coding of multimedia and hypermedia information -- Part 5 Support for base-level interactive applications ISO/IEC 13522-8 2001 Information technology -- Coding of multimedia and hypermedia information -- Part 8 XML notation for ISO/IEC 13522-5 ISO/IEC 18056 2007 Information technology -- Telecommunications and information exchange between systems -- XML Protocol for Computer Supported Telecommunications Applications (CSTA) Phase III ISO/IEC 19503 2005 Information technology -- XML Metadata Interchange (XMI) ISO/IEC 19776-1 2005 Information technology -- Computer graphics, image processing and environmental data representation -- Extensible 3D (X3D) encodings -- Part 1 Extensible Markup Language (XML) encoding ISO/IEC 22537 2006 Information technology -- ECMAScript for XML (E4X) specification ISO 22643 2003 Space data and information transfer systems -- Data entity dictionary specification language (DEDSL) -- XML/DTD Syntax ISO/IEC 23001-1 2006 Information technology -- MPEG systems technologies -- Part 1 Binary MPEG format for XML ISO 24531 2007 Intelligent transport systems -- System architecture, taxonomy and terminology -- Using XML in ITS standards, data registries and data dictionaries XHTML XHTML™ 1.0 The Extensible HyperText Markup Language (Second Edition) MHTML RFC2110 (旧) RFC2557 (新) MIMEタイプ Multipurpose Internet Mail Extensions (MIME) Part 1~3 RFC 2045, RFC 2046, RFC 2047 Multipurpose Internet Mail Extensions(MIME) Part Five Conformance Criteria and Examples RFC 2049 MIME Parameter Value and Encoded Word Extensions Character Sets, Languages, and Continuations RFC2231 Media Type Specifications and Registration Procedures RFC 4288 Multipurpose Internet Mail Extensions (MIME) Part Four Registration Procedures RFC 4289(旧RFC 2048) Returning Values from Forms multipart/form-data RFC2388 Internet Message Format RFC 5322 (旧RFC 822、RFC 2822) SMTP RFC5321, RFC2821, RFC821 Communicating Presentation Information in Internet Messages The Content-Disposition Header Field RFC2183 Uniform Resource Identifiers (URI) Generic Syntax RFC3986 (旧) RFC1738 Uniform Resource Locators (URL) RFC1808 Relative Uniform Resource Locators RFC2396 Uniform Resource Identifiers (URI) Generic Syntax IRI(Internationalized Resource Identifier) RFC 3987 XRI(Extensible Resource Identifier) The text/html Media Type RFC2854 仕様 マークアップ言語①視覚マークアップ(暗黙) ②手続きマークアップ(明示) ③意味マークアップ 他の用途での利用 Tex SGML(Standard Generalized Markup Language) HTML(HyperText Markup Language) XML(Extensible Markup Language) XHTML(Extensible HyperText Markup Language) マークアップ言語 コンピュータ言語の一種 GML(Generalized Markup Language)から派生 文章の構造（段落など）、見栄え（フォントサイズなど）に関する指定を文章とともにテキストファイルに記述するための言語 文章に対するそれらの指定をマークアップ (markup) と呼び、マークアップを記述するための文字列をタグ (tag) と呼ぶ テキスト＋マークアップ命令 ①視覚・②手続き・③意味マークアップに分類 ①視覚マークアップ(暗黙) テキスト中の「手掛かり」から文書構造を推論 改行、スペース、行送り、中央ぞろえ等 ②手続きマークアップ(明示) ファイル中の出現順で処理系に解釈 テキストを並べ書式指定の命令（ディレクティブ）を指示 後にはそれらの効果を打ち消す命令 マクロやスタックモデルなどのより高度なシステムならば、この煩わしさは軽減される チューリング完全なプログラミング言語に相当 例：nroff, troff, TeX, Lout ③意味マークアップ 必ずしも特定の見栄えなどの処理上の意味を与えることなく、テキストの断片に印を付けていくもの 例えば、Atomシンディケーション言語には updated タイムスタンプを印すマークアップがあり、情報項目が最後にいつ更新されたのかを発行者が表明するのに使われる。 Atomの規格ではupdatedの意味するものについて論じており、そのマークアップ形式についても規定されているが、それがユーザに対してどのように表示されるのか、またそもそも表示されるべきなのかについては何の規定もない。このマークアップは処理系ごとに様々な用途に使われ、その中にはAtom言語の設計者たちが予想もしなかったものが多く含まれるだろう。SGMLとXMLは意味マークアップ言語の設計を支援するために設計された仕様（メタ言語）である。 以上は概念的な分類であって、実際にはどのシステムでも別種のマークアップが共存している。例えばHTMLでは、純粋な手続きマークアップ（ボールドのためのBなど）と純粋な意味マークアップ（BLOCKQUOTEやHREF属性など）が共存している。HTMLにはさらにPRE要素があり、視覚マークアップの領域を囲んで、テキストをタイプしたとおりに表示させることもできる。 マークアップ要素とその使用に関する規則は通例、特定の企業やコミュニティごとの様々な種類の文書に対応するため、標準化団体によって開発される。最初期の例としてはCALSがあり、アメリカ軍で技術マニュアルに利用されていた。すぐに大規模文書を管理する必要のある企業がこれに続きだし、航空機、電気通信、自動車、コンピュータハードウェアのマニュアル用のタグ群が開発された。これはこの種のマニュアルの多くが電子的に配布されるきっかけとなり、企業は1つの（意味マークアップによる）オリジナルから印刷物、オンライン、CD版などを作り出すことができた。特筆すべき例はサン・マイクロシステムズであり、ジョン・ボサック（en）がSGMLを複数媒体向けの文書配布に採用し、大幅なコスト削減を達成した。 よく知られたマークアップ言語 DocBook、MathML、SVG、Open eBook、TEI、XBRLなど 多くはテキストのためのものだが、その他の用途で使われる専門化された言語もある。 汎用マークアップとは意味マークアップの別名 現在のほとんどの意味マークアップシステムは文書を木構造に構造化する。また同時に、文書の一部分を文書内の他の箇所から参照する（クロス・リファレンス）手段を提供している。構造化によって、ソフトウェアが文書構造を（BLOBではないものとして）把握することができ、文書はデータベースとして扱うことが可能になる。リレーショナル・データベースが持っているような厳格なスキーマを持たないので、「半構造化データベース（semi-structured database）」と呼ばれる。 000年を過ぎたころから、木構造以外の文書構造に関する大きな関心が現れてきた。例えば、古代の宗教文学では文献構造（本、章、節、文）以外にも、修辞構造や散文構造が広く用いられる（ストーリー、引用章句、段落、など）。これらの文書単位は文中でたびたび交差するので、簡単には木構造のマークアップシステムでデータ化することはできない。このような構造をサポートする文書モデリングシステムにはMECS（ウィトゲンシュタインの作品を電子化するために開発された）、TEI Guidelinesの一部、LMNL、CLIX、などがある。 意味マークアップの第一の長所はその自由度だとみなされている。テキストの断片が「どのように表示されるべきか」ではなく「何であるか」と印されていたなら、その言語の設計者が予想もしていなかった便利な用途でその断片を処理する処理系が作られるかもしれない。例を挙げると、HTMLのハイパーリンクは、元々、リンクをたどる人の手で利用されるために設計されたが、WWW検索エンジンによって、インデックスするべき新しいリソースを発見するため、またウェブ上のリソースの人気を測るためにも利用されている。 意味マークアップはまた、必要になったときに文書の見栄えを変更する作業も単純化する。これは文書の見栄えと内容が密接に結びついていないからである。例えばイタリックを強調と外国語であることを示すために使うとする。ここで両方が単にイタリックと（視覚的にまたは手続き的に）マークアップされたなら、2つを選り分けることが困難になる。もし、あとから外国語をイタリックにしないと決め直したら、全てのイタリック部分を見直して、1つずつ選り分けるしか方法がない。しかし始めから、2つの場合が別のタグで（意味的に）マークアップされていたのなら、互いに干渉しあうことなく、見栄えの変更ができるようになる。 他の用途での利用 マークアップ言語のアイデアはテキスト文書に関するものとして生まれたが、ベクターグラフィックス、Webサービス、ウェブシンディケーション、セマンティック・ウェブ、ユーザーインタフェースなどの分野での利用も増えている。これらのほとんどはXMLのアプリケーションである。XMLを使用することで、複数のマークアップ言語を合成することが可能となる。例としては、XHTML+SMIL やXHTML+MathML+SVGがある。 Tex 数学書を業務品質で組むためのテキストやフォントに関する綿密なレイアウト機能を目標としている ユーザーに高いスキルを要求するため、主に学術分野で使われ、理数系の出版物・論文などではデファクトスタンダードとなっている。TeXのマクロパッケージであるLaTeXはTeX上で意味マークアップシステムを構築しており、広く用いられている。 SGML(Standard Generalized Markup Language) マークアップは文書の構造面に専念し、視覚的な表現に関しては処理系に任せるべきだ、という思想 文書にマークアップを含める構文や、どんなタグがどこで使えるのかなどを記述する構文（DTD）を規定 これによって、文書作成者は望むマークアップを、最も意図に近いものや母語で名前が付いているものなど、何でも作成し、利用することができた。それゆえ、SGMLは正しくはメタ言語であり、多くの具体的なマークアップ言語がそれから派生していった。80年代から現在に至るまで、ほとんどの新しいマークアップ言語はSGMLに基づいたものであった。TEIやDocBookなどがその例である。SGMLは1986年にISO 8879として国際標準になった。 非常に大きな規模の文書を扱う現場で広く受け入れられ、利用された。しかしながら、一般的には覚えるのが煩わしくて難しいとみなされている。これは多彩すぎる機能と高すぎる柔軟性を実現した副作用である。複雑な仕様の例として、SGMLでは終了タグ（または開始タグかその両方）が文脈によって省略可能となっているが、これは過労気味のサポートスタッフがマークアップを手動で行うような場合にキーストロークの節約が望まれている、との配慮によるものである。 World Wide Web(W3C)勧告 HTML(HyperText Markup Language) 1991年になると、SGMLが商用のデータベース用途にしか使われない傾向が強くなってきた。一方、（文書をプロプライエタリなバイナリフォーマットで保存する）WYSIWYGツールがその他の文書処理用途では受け入れられていた。 そんな折、SGMLの構文を使ってHTMLは作られた。 HTMLは他のSGMLベースのタグ言語とよく似ているが、よりシンプルなものとして誕生し、当初は形式的なDTDを持っていなかった。 DeRose はHTMLによる意味マークアップ(SGML)の使用が、ウェブに柔軟性と拡張性をもたらし、その成功の有力な要因となったと主張している(その他の要因にはURLの概念やブラウザの無料配布などがある)。現在、HTMLはおそらく世界で最もよく使われているマークアップ言語であろう。 しかしながら、HTMLがマークアップ言語であるという事実については異論を唱える研究者もいる。その異論とは、HTMLはタグの配置を制限しており、タグに他のタグ内に入れ子になることと文書のルートタグになることの両方を要求している、というものである。このため、そのような研究者たちはHTMLは階層型データモデルに従う「コンテナ言語」ではないかと述べている。 HTML4.01 SGMLに Strict、Transitional、FramesetがDTDで定義されている HTML5.0 XML(Extensible Markup Language) 対象をインターネット上の文書に特化することで、SGMLを単純化したサブセットを作ることが目的 XMLはSGMLと同じようにメタ言語である。また、（"extensible"という名のとおり）利用者が必要な要素を追加したり、名前空間を使って複合文書を作ったりして拡張することが容易にできる。 名前空間などを用いないXML文書はSGML文書でもあるため、XMLへの乗り換えはそれほど困難でなく、既存のSGMLの利用者およびソフトウェアは比較的容易にXMLに移行することができた。XMLはSGMLの多くのより複雑な機能を省いており、学習や実装を容易にしている。他の改良点には、多言語環境でのSGMLの問題点を修正したことや、スキーマがない文書でも利用を可能にしたことなどがある。 XMLはそもそも文書や出版物などの半構造データのために設計されたものである。しかしながら、その単純さと柔軟性のバランスの良さから、他の用途でも急速に受け入れられていった。例えば、アプリケーション間でデータをやりとりするために利用されたり、アプリケーションの設定ファイルの構造として利用されたりもしている。 XHTML(Extensible HyperText Markup Language) 2000年の1月から、HTMLについてのすべてのW3C勧告は、SGMLではなくXMLに基づいたものになった。Extensible Hypertext Markup Language を略してXHTMLという。（XはExの発音から。） HTMLとXHTMLとの違いで顕著なものの1つ 「すべてのタグは閉じなければならない」 br のような「空の」HTMLタグは「閉じる」必要がある。XHTML 1.0勧告内のAppendixにあるHTML Compatibility Guidelines[5]では、 br / のように要素名の後に空白文字と斜線を入れて閉じる形を推奨している。 他に開始タグ内の属性値はすべて引用符 で囲わなければならないという点がある。 また、HTMLとは異なり、大文字と小文字は厳密に区別される。
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Metabolic network analysis on Phaffia rhodozyma yeast using 13C-labeled glucose and gas chromatography-mass spectrometry C Cannizzaro, B Christensen, J Nielsen, U … - Metabolic Engineering, 2004 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related xVq5KkaMAd4J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Amino acid labeling patterns, as determined by GC–MS, were in accordance with a metabolic network consisting of the Embden–Meyerhof–Parnas pathway, the pentose phosphate pathway, and the TCA cycle. Glucose was mainly consumed along the pentose ... Metabolic network analysis integrated with transcript verification for sequenced genomes A Manichaikul, L Ghamsari, EFY Hom, C Lin, RR … - Nature methods, 2009 - nature.com http //scholar.google.com/scholar?q=related qlItzvkCLowJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Present availability of genome sequences for diverse microorganisms brings opportunities for metabolic engineering through systems-level characterization of these organisms metabolic networks 1 . Such efforts require both functional and structural annotation of metabolic ... High-throughput metabolic flux analysis based on gas chromatography-mass spectrometry derived 13C constraints E Fischer, N Zamboni, U Sauer - Analytical biochemistry, 2004 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related AGqwTbFzQbYJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 Influence of metabolic network structure and function on enzyme evolution biomedcentral.com [HTML]D Vitkup, P Kharchenko, A Wagner - Genome biology, 2006 - biomedcentral.com http //scholar.google.com/scholar?q=related tyk--z8xdr0J scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... Cold Spring Harbor Press, NY; 1982. OpenURL. Papp B, Pal C, Hurst LD Metabolic network analysis of the causes and evolution of the enzyme dispensability in yeast. Nature 2004,429 661-664. PubMed Abstract | Publisher Full Text OpenURL. ... 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Metabolic network analysis during fed-batch cultivation of Corynebacterium glutamicum for pantothenic acid production first quantitative data and analysis of by- … C Chassagnole, A Diano, F Létisse, ND Lindley - Journal of biotechnology, 2003 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related CJC7H27nMvMJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 A first generation genetically modified strain of Corynebacterium glutamicum has been assessed for its potential to synthesise and accumulate the vitamin pantothenic acid in the medium using fed-batch cultivation technology, with biomass concentration controlled by isoleucine ... Metabolic modeling of microbial strains in silico ru.nl [PDF]MW Covert, CH Schilling, I Famili, JS Edwards, … - Trends in Biochemical …, 2001 - Elsevier http //scholar.google.com/scholar?q=related pjh6sWp3MRMJ scholar.google.com/ hl=ja as_sdt=2000 ... labeling experiments. Adv. Biochem. Eng. Biotechnol. 54, pp. 109–154. 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